MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 7823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015724	TGG	2	6	102	107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323775
2	NC_015724	GAA	2	6	169	174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323775
3	NC_015724	CCAG	2	8	252	259	25 %	0 %	25 %	50 %	339323775
4	NC_015724	TG	3	6	270	275	0 %	50 %	50 %	0 %	339323775
5	NC_015724	CG	4	8	284	291	0 %	0 %	50 %	50 %	339323775
6	NC_015724	CAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323775
7	NC_015724	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323775
8	NC_015724	GGT	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323775
9	NC_015724	TGC	2	6	543	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323775
10	NC_015724	GAT	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323775
11	NC_015724	GAC	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
12	NC_015724	CATC	2	8	719	726	25 %	25 %	0 %	50 %	339323775
13	NC_015724	GCAA	2	8	761	768	50 %	0 %	25 %	25 %	339323775
14	NC_015724	GAAA	2	8	822	829	75 %	0 %	25 %	0 %	339323775
15	NC_015724	CCTA	2	8	867	874	25 %	25 %	0 %	50 %	339323775
16	NC_015724	TGGCG	2	10	1054	1063	0 %	20 %	60 %	20 %	339323775
17	NC_015724	TGA	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323775
18	NC_015724	GCA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
19	NC_015724	CGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
20	NC_015724	GGA	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323775
21	NC_015724	C	6	6	1371	1376	0 %	0 %	0 %	100 %	339323776
22	NC_015724	GAT	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323776
23	NC_015724	GGC	2	6	1414	1419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323776
24	NC_015724	AGC	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
25	NC_015724	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
26	NC_015724	TAC	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323776
27	NC_015724	CGT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323776
28	NC_015724	GC	3	6	1660	1665	0 %	0 %	50 %	50 %	339323776
29	NC_015724	TGCT	2	8	1734	1741	0 %	50 %	25 %	25 %	339323776
30	NC_015724	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323776
31	NC_015724	AAG	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323776
32	NC_015724	GCT	2	6	2068	2073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323776
33	NC_015724	ACT	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323776
34	NC_015724	CCG	2	6	2089	2094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323776
35	NC_015724	GCA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
36	NC_015724	ACGG	2	8	2239	2246	25 %	0 %	50 %	25 %	339323776
37	NC_015724	CCT	2	6	2906	2911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323777
38	NC_015724	TGC	2	6	2930	2935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323777
39	NC_015724	CAT	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323777
40	NC_015724	CAG	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323777
41	NC_015724	CGG	2	6	3070	3075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323777
42	NC_015724	GAAG	2	8	3173	3180	50 %	0 %	50 %	0 %	339323777
43	NC_015724	CGG	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
44	NC_015724	GC	3	6	5109	5114	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
45	NC_015724	CG	3	6	5117	5122	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
46	NC_015724	GTT	2	6	5136	5141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323778
47	NC_015724	GCA	2	6	5248	5253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
48	NC_015724	TCG	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
49	NC_015724	GCTTG	2	10	5392	5401	0 %	40 %	40 %	20 %	339323778
50	NC_015724	CAC	3	9	5420	5428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323778
51	NC_015724	AGC	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
52	NC_015724	GCG	2	6	5454	5459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
53	NC_015724	GGC	2	6	5517	5522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
54	NC_015724	GGCC	2	8	5575	5582	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
55	NC_015724	CCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323778
56	NC_015724	CGG	2	6	5646	5651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
57	NC_015724	CAG	3	9	5666	5674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
58	NC_015724	CAC	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323778
59	NC_015724	CG	4	8	5681	5688	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
60	NC_015724	AGG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323778
61	NC_015724	GCC	2	6	5805	5810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
62	NC_015724	GCC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
63	NC_015724	GCC	2	6	5897	5902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
64	NC_015724	CCAG	2	8	5920	5927	25 %	0 %	25 %	50 %	339323778
65	NC_015724	A	6	6	5930	5935	100 %	0 %	0 %	0 %	339323778
66	NC_015724	GCA	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
67	NC_015724	GC	3	6	6002	6007	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
68	NC_015724	GTGC	2	8	6012	6019	0 %	25 %	50 %	25 %	339323778
69	NC_015724	TCG	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
70	NC_015724	ACGC	2	8	6113	6120	25 %	0 %	25 %	50 %	339323778
71	NC_015724	AGG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323778
72	NC_015724	GTCCCG	2	12	6176	6187	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339323778
73	NC_015724	GC	3	6	6227	6232	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
74	NC_015724	GTC	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
75	NC_015724	CG	3	6	6428	6433	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
76	NC_015724	GGCACA	2	12	6456	6467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
77	NC_015724	GCCG	2	8	6475	6482	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
78	NC_015724	TCG	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
79	NC_015724	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
80	NC_015724	CGG	2	6	6610	6615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
81	NC_015724	CGG	2	6	6660	6665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
82	NC_015724	GA	3	6	6684	6689	50 %	0 %	50 %	0 %	339323778
83	NC_015724	GCT	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
84	NC_015724	CGG	2	6	6775	6780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
85	NC_015724	CG	3	6	6805	6810	0 %	0 %	50 %	50 %	339323778
86	NC_015724	TCGG	2	8	6822	6829	0 %	25 %	50 %	25 %	339323778
87	NC_015724	CGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
88	NC_015724	CCG	2	6	7836	7841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
89	NC_015724	CGA	2	6	7880	7885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
90	NC_015724	CGC	3	9	7906	7914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
91	NC_015724	GCC	2	6	7916	7921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
92	NC_015724	CGC	2	6	7942	7947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
93	NC_015724	CTG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
94	NC_015724	TGAG	2	8	7963	7970	25 %	25 %	50 %	0 %	339323779
95	NC_015724	TGGCG	2	10	7997	8006	0 %	20 %	60 %	20 %	339323779
96	NC_015724	TGC	3	9	8008	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
97	NC_015724	GTT	2	6	8027	8032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323779
98	NC_015724	ATGT	2	8	8040	8047	25 %	50 %	25 %	0 %	339323779
99	NC_015724	GAT	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323779
100	NC_015724	CTG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
101	NC_015724	GCCG	2	8	8129	8136	0 %	0 %	50 %	50 %	339323779
102	NC_015724	CGA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
103	NC_015724	CGATG	2	10	8177	8186	20 %	20 %	40 %	20 %	339323779
104	NC_015724	CATG	2	8	8252	8259	25 %	25 %	25 %	25 %	339323779
105	NC_015724	CTG	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
106	NC_015724	GAG	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323779
107	NC_015724	CGG	2	6	8330	8335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323779
108	NC_015724	CCGG	2	8	8339	8346	0 %	0 %	50 %	50 %	339323779
109	NC_015724	GCC	2	6	8363	8368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
110	NC_015724	GAC	2	6	8421	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
111	NC_015724	CGC	2	6	8440	8445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
112	NC_015724	TCA	2	6	8446	8451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323779
113	NC_015724	ATCC	2	8	8484	8491	25 %	25 %	0 %	50 %	339323779
114	NC_015724	GCC	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
115	NC_015724	CGGC	2	8	8516	8523	0 %	0 %	50 %	50 %	339323779
116	NC_015724	TGG	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323779
117	NC_015724	TCC	2	6	8557	8562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323779
118	NC_015724	TGT	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323779
119	NC_015724	CTG	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
120	NC_015724	TTCT	2	8	8670	8677	0 %	75 %	0 %	25 %	339323779
121	NC_015724	CAA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323779
122	NC_015724	GCG	2	6	8770	8775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323779
123	NC_015724	TGC	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
124	NC_015724	ACCC	2	8	8817	8824	25 %	0 %	0 %	75 %	339323779
125	NC_015724	CGC	2	6	8834	8839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
126	NC_015724	GCA	3	9	8846	8854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
127	NC_015724	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323779
128	NC_015724	CGGG	2	8	8942	8949	0 %	0 %	75 %	25 %	339323779
129	NC_015724	CTT	2	6	9259	9264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323780
130	NC_015724	GAG	2	6	9283	9288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
131	NC_015724	CGT	2	6	9366	9371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
132	NC_015724	TGA	2	6	9375	9380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323780
133	NC_015724	AC	3	6	9387	9392	50 %	0 %	0 %	50 %	339323780
134	NC_015724	CG	3	6	9536	9541	0 %	0 %	50 %	50 %	339323780
135	NC_015724	GGGC	2	8	9555	9562	0 %	0 %	75 %	25 %	339323780
136	NC_015724	CGGA	2	8	9593	9600	25 %	0 %	50 %	25 %	339323780
137	NC_015724	GTG	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323780
138	NC_015724	AGC	2	6	9668	9673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323780
139	NC_015724	TGA	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323780
140	NC_015724	GGA	2	6	9717	9722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
141	NC_015724	TGC	2	6	9758	9763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
142	NC_015724	GGA	2	6	9849	9854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
143	NC_015724	GCTTG	2	10	9867	9876	0 %	40 %	40 %	20 %	339323780
144	NC_015724	GAG	2	6	9905	9910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
145	NC_015724	ATC	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323780
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147	NC_015724	GAA	2	6	10017	10022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323780
148	NC_015724	TGC	2	6	10033	10038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
149	NC_015724	GAT	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323781
150	NC_015724	CAT	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323781
151	NC_015724	CTG	2	6	10399	10404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
152	NC_015724	CGC	2	6	10411	10416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323781
153	NC_015724	TGC	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
154	NC_015724	GCT	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
155	NC_015724	GC	3	6	10472	10477	0 %	0 %	50 %	50 %	339323781
156	NC_015724	GGAC	2	8	10500	10507	25 %	0 %	50 %	25 %	339323781
157	NC_015724	GGCC	2	8	10511	10518	0 %	0 %	50 %	50 %	339323781
158	NC_015724	GCT	3	9	10545	10553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
159	NC_015724	CAGC	2	8	10581	10588	25 %	0 %	25 %	50 %	339323781
160	NC_015724	GGCA	2	8	10647	10654	25 %	0 %	50 %	25 %	339323781
161	NC_015724	CTG	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
162	NC_015724	TGC	2	6	10700	10705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
163	NC_015724	CAC	2	6	10707	10712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323781
164	NC_015724	GCT	2	6	10713	10718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
165	NC_015724	GGC	2	6	10719	10724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323781
166	NC_015724	GCA	2	6	10755	10760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323781
167	NC_015724	CTA	2	6	10819	10824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323781
168	NC_015724	ACG	2	6	10837	10842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323781
169	NC_015724	GAGC	2	8	10959	10966	25 %	0 %	50 %	25 %	339323781
170	NC_015724	TGCG	2	8	10970	10977	0 %	25 %	50 %	25 %	339323781
171	NC_015724	TGC	2	6	11036	11041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
172	NC_015724	GTA	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323781
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185	NC_015724	CG	3	6	11898	11903	0 %	0 %	50 %	50 %	339323782
186	NC_015724	CCTG	2	8	11913	11920	0 %	25 %	25 %	50 %	339323782
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200	NC_015724	ATCG	2	8	12401	12408	25 %	25 %	25 %	25 %	339323782
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262	NC_015724	CCG	2	6	15534	15539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323784
263	NC_015724	CG	3	6	15795	15800	0 %	0 %	50 %	50 %	339323785
264	NC_015724	TGCCG	2	10	15849	15858	0 %	20 %	40 %	40 %	339323785
265	NC_015724	CCA	2	6	15891	15896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323785
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275	NC_015724	GCCA	2	8	16394	16401	25 %	0 %	25 %	50 %	339323785
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284	NC_015724	TGT	2	6	16719	16724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323785
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371	NC_015724	GC	3	6	19857	19862	0 %	0 %	50 %	50 %	339323788
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376	NC_015724	CG	3	6	20246	20251	0 %	0 %	50 %	50 %	339323788
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382	NC_015724	GCC	3	9	20595	20603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323788
383	NC_015724	ACG	2	6	20659	20664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323788
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385	NC_015724	GGCCG	2	10	20739	20748	0 %	0 %	60 %	40 %	339323788
386	NC_015724	TCC	2	6	20803	20808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323788
387	NC_015724	CGGC	2	8	20845	20852	0 %	0 %	50 %	50 %	339323788
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389	NC_015724	GTC	2	6	20906	20911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323789
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